Okulumuz ilk olarak 2012-2013 eğitim öğretim yılında Pendik Anadolu İmam Hatip Lisesine bağlı ek bina olarak ilk öğrencilerini kabul etmeye başladı.

Ardından 2013-2014 eğitim öğretim yılında Kavakpınar Anadolu İmam Hatip Lisesi´ne bağlandı.

2014 Ocak ayında müstakil İmam Hatip Ortaokulu olarak Güven KARABACAK´ın Kurucu Müdür olarak atanmasıyla şu anki mevcut statüsüne kavuştu.

2015-2016 Eğitim öğretim yılından itibaren merkez binamızın yeterli gelmemesi dolayısıyla yaklaşık 400 öğrencimiz okulumuza 500 metre mesafede bulunan Ahmet Yesevi İlkokulu´nda sabahçı olarak eğitim gördü.

2023-2024 Eğitim öğretim yılından itibaren kız öğrencilerimiz sabahçı, erkek öğrencilerimiz öğlenci olarak ana binamızda ikili eğitim öğretim yapmaya başladı.